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L’attività scientifica di IIT si sviluppa sul piano strategico triennale proposto dal Direttore scientifico e da una commissione di ricercatori senior dell'Istituto e che viene approvato dal Comitato Tecnico Scientifico (CTS) e dal Comitato Esecutivo della Fondazione. Il Piano strategico viene periodicamente aggiornato sotto la supervisione del CTS. Il piano strategico 2015 - 2017 dell’Istituto è sostenuto da 11 programmi ognuno dei quali è sviluppato da un certo numero di Principal Invistigator (PI) che operano in completa autonomia ed indipendenza nel laboratorio centrale e nei centri di ricerca satelliti svolgendo la propria linea di ricerca e contribuendo ad uno o più programmi secondo la Matrice di Ricerca dell’Istituto.

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